ILHO AHN

Mini Research

Experiments driven by personal curiosity

BIO ML Carbon-3B: 6-mer token phase sensitivity 측정 Carbon-3B로 BRCA2 MVE SNV를 점수화할 때 6-mer token phase가 score IQR 대비 얼마나 흔드는지, FNS가 그 흔들림을 얼마나 줄이는지 점검한 노트.

PROTEIN ML 작은 backbone 생성/편집 모델에서 designability를 만드는 구조 단서 수준 작은 backbone 생성/편집 모델에서 국소 기하 정보, 약한 topology 단서, 자연 단백질 구조 core 조건을 비교해 designability에 필요한 구조 단서 수준을 정리한다.

1. BIO ML OpenBind prediction score를 구조 신호로 읽을 수 있을까 OpenBind EV-A71 2A release에서 공개 prediction score가 측정 pKD와 보이는 상관이 MW+cLogP 영향을 뺀 뒤에도 유지되는지 점검한 노트.
2. BIO ML BioML에서 검증한 Looped Transformer: 안정적 개선으로 이어지지 않은 반복 구조 Looped Transformer를 여러 BioML 평가 문제에 적용했지만 안정적 개선으로 분리되지 않은 경계 결과를 정리한다.
3. SINGLE CELL ML HSPC hierarchy low-anchor benchmark: pca30-B3와 nested scGPT fusion normal cHSPC fine-state recovery에서 pca30-B3 기준과 nested scGPT 결합의 outer-test primary-score 개선, 보정과 확률 오차 한계를 정리한다.
4. PROTEIN ML Low-label Protein Fitness 실험: Frozen ESM2와 LoRA의 label budget 비교 라벨을 많이 모으기 어려운 protein fitness 예측에서 frozen ESM2 embedding만 쓰는 방법과 LoRA로 조금 적응시키는 방법을 같은 label budget 안에서 비교한다.
5. LLM EVAL 4B급 Gemma3와 Gemma4 한국어 SFT 비교: 품질, 학습, 노이즈 Gemma3와 Gemma4를 한국어 instruction 환경에서 비교했다. base 품질, QLoRA SFT 후 성능, 학습 효율, 입력 노이즈 안정성을 정리한다.